De 1º de agosto de 2015 até 13 de fevereiro de 2016, 1.546 casos de microcefalia foram notificados em Pernambuco. Desse total, 600 (38,8%) atendem aos parâmetros da Organização Mundial de Saúde (OMS) para microcefalia, que identifica a malformação em bebês com perímetro cefálico igual ou menor que 32 centímetros. Ao todo, 184 casos foram confirmados como microcefalia e 159 foram descartados - levando em consideração o resultado dos exames de imagem dos bebês.
Também foram registrados nove casos de bebês natimortos e sete que vieram a óbito logo após o nascimento. Destaca-se que nenhum dos casos teve microcefalia como causa básica de morte. Os óbitos foram de residentes dos municípios de Recife (03), Ipojuca (03), Bodocó (01), Bom Jardim (1), Caruaru (1), Floresta (1), Goiana (1), Ipubi (1), Olinda (1), Petrolina (1), São Caetano (1) e São Lourenço da Mata (1).

Em Pernambuco, o Centro de Pesquisa Aggeu Magalhães/Fiocruz confirmou 34 casos de microcefalia relacionados ao vírus zika por detecção do anticorpo IgM no líquido céfalorraquidiano. Os reagentes foram fornecidos pelo Centro de Controle de Doenças dos EUA (CDC). Outros 3 casos deram negativos e 1 teve resultado inconclusivo, totalizando 38 testes realizados.